A área de concentração do programa é Bioinformática, dividida em três linhas de pesquisa que apresentam propósitos complementares. A linha de pesquisa Biologia Estrutural e Funcional compreende um amplo campo do conhecimento e propõe entender a estrutura e o funcionamento de organismos e sistemas biológicos. A linha de pesquisa Biologia Computacional usa e desenvolve métodos computacionais, estatísticos e matemáticos aplicados a problemas biológicos. Já a linha de pesquisa Inteligência Artificial e Mineração de Dados desenha sistemas inteligentes para descoberta e reconhecimento de padrões em dados biológicos. Na intersecção com a bioinformática, todas as três linhas de pesquisa priorizam a geração, o processamento e a análise de dados moleculares em larga escala.